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中国(海南)改革发展研究院
中改院成立于1991年11月1日，是以改革发展政策研究为主要业务的研究机构。办院宗旨是“立足海南，面向全国，走向世界”，致力于服务中国经济社会改革的政策决策，坚持“小机构、大网络”的运作机制与“网络型、国际化、独立性”的机构特色。中改院成立以来，以“直谏中国改革”为已任，努力建设中国改革智库，向中央有关部门提交改革政策、立法建议报告200余份；撰写改革调研报告500份；先后承担100多项改革政策咨询课题；出版改革研究专编著290余部，发表论文2000余篇。所提交政策建议，有些直接为中央决策所采纳，有些被用作制定政策和法规的重要参考。获得包括国家“五个一工程”奖、“孙冶方经济科学奖”、“中国发展研究奖”等多种国家级奖项。
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生物化学与细胞生物学研究所
生化与细胞所）成立于2000年5月，由原中国科学院上海生物化学研究所与原中国科学院上海细胞生物学研究所整合而成。生化与细胞所是我国生命科学领域最具科研实力和影响力的国立研究机构之一。研究所定位于生命科学基础研究，在PI制的基础上，针对当今生物化学和细胞生物学主要前沿研究方向，围绕国家重点实验室和研究中心形成了三大研究集群，涵盖五大前沿领域。形成了以分子生物学国家重点实验室、细胞生物学国家重点实验室、国家蛋白质科学研究中心•上海（筹）为支撑的三大研究集群，涵盖基因调控、RNA、表观遗传学，蛋白质科学，细胞信号转导，细胞与干细胞生物学，癌症和其它重大疾病机理五大前沿领域。
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中国劳动和社会保障科学研究院
研究院是人力资源和社会保障部直属社会公益性科研机构，其前身是1993年成立的中国劳动科学研究院，1999年更名为中国劳动保障科学研究院，2017年10月，与劳动科学研究所、劳动工资研究所、国际劳动保障研究所、社会保障研究所整合为中国劳动和社会保障科学研究院。主要职责和任务是：开展劳动和社会保障基础理论、决策支持和应用技术开发研究；参与劳动和社会保障领域的政策研究、制定和评估；开展劳动和社会保障理论和政策咨询服务；研究、开发、推广劳动和社会保障科研成果；培养劳动和社会保障科研及科技经营管理人才；开展劳动和社会保障领域有关国际、国内学术交流与合作；编辑出版劳动和社会保障专业书刊及参考资料；提供劳动和社会保障科研网络信息服务。
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中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心
中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心的前身为中国科学院石家庄农业现代化研究所。1978年，国家为加强农业综合研究能力、适时转化农业科研成果、推进农业现代化建设与发展，经报请中央批准，中国科学院与河北省共同组建了“中国科学院石家庄农业现代化研究所”。2002年，与中国科学院遗传与发育生物学研究所进行整合，成立了“中国科学院遗传发育所农业资源研究中心”，保留独立事业单位法人。战略定位：以保障国家粮食安全、水安全与生态安全的战略需求为目标，以农业水资源高效利用研究为核心，创新资源生态学理论与资源节约型现代农业技术体系，强化技术成果转化与社会化服务，将农业资源研究中心逐步建设成为国内外有影响力的创新单元。
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中国科学院昆明动物研究所
中国科学院昆明动物研究所成立于1959年4月，其前身为昆虫研究所紫胶站。1963年曾改名为中国科学院西南动物研究所，1970年划归云南省后，改名为云南省动物研究所，1978年重归中国科学院，恢复原所名。中国科学院昆明动物研究所围绕“一三五”发展规划，确定了立足西南及东南亚丰富的生物多样性资源，凝练了“重大疾病灵长类新型动物模型创制与新药研究”、“基因组进化的理论突破”、“家养动物及其野生近缘种基因资源发掘”等三个重点突破方向。
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中国贸促会研究院
中国国际贸易促进委员会研究院（简称“中国贸促会研究院”，Academy of China Council for the Promotion of International Trade）是中国贸促会直属的研究机构，于2016年1月挂牌成立。中国贸促会研究院致力于打造具有中国特色和国际影响力的经贸类智库，立足学术，服务政府，代言工商。主要职责是：利用中国贸促会“亦官亦民”的体制优势和国际化资源优势，以及与境内外工商界广泛联系的渠道优势，围绕国家经济发展和对外工作大局，开展国际贸易、国际投资、世界经济、国内外市场、电子商务、商事法律等领域的研究，承接国际组织、各级政府、贸促系统、工商企业等方面委托的研究课题，为国家战略研究、政策制定、地方规划、产业发展、企业经营等提供研究咨询服务，建设一流的学术人才队伍，撰写一流的内参研究报告，举办一流的会议论坛活动。
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中国社会科学院近代史研究所
中国社会科学院近代史研究所，是国家级专业中国近代历史研究机构，主要研究1840—1949年间的中国历史，内容涉及这一时期的政治、军事、经济、外交、思想、文化、社会等领域和香港、澳门、台湾地区的历史。其前身为建于1938年的延安马列学院历史研究室，1950年5月1日成立中国科学院近代史研究所，1977年5月改称现名。现设有：晚清史研究室、近代经济史研究室、近代社会史研究室、近代思想史研究室、革命史研究室、中华民国史研究室、近代中外关系史研究室、台湾史研究室、抗日战争史研究室、近代文化史研究室、近代通史研究室、《近代史资料》编译室、所刊编辑部（包括《近代史研究》、《抗日战争研究》Journal of Modern Chinese History等3个编辑部）、综合处。学术团体有：中国史学会、中国现代文化学会、中国抗日战争史学会、中国孙中山研究会、中国中俄关系史研究会。研究中心有：中国社会科学院台湾史研究中心、中国近代思想研究中心、中国近代社会史研究中心、中日历史研究中心、近代以来中国历史学知识体系研究中心。
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当代中国研究所
当代中国研究所是1990年6月28日经中共中央批准成立的。当代中国研究所的主要任务是研究、编纂和出版中华人民共和国史，搜集和编辑有关国史资料，参与国史的宣传与教育，联系与协调各地区、各部门的国史研究工作。所内设办公室、科研办公室和政治史研究室、经济史研究室、文化史研究室、社会史研究室、外交史与港澳台史研究室、理论研究室8个机构，事业编制100人。研究所致力于中华人民共和国史学科建设。建有面向全国征文的国史学术年会制度和每五年举办一次的当代中国史国际高级论坛制度，至今已举办9届年会和两届国际论坛。与俄罗斯科学院远东研究所签订了长期科研合作交流协议，并接收国内外的访问学者。主办关于中华人民共和国史的专业期刊——《当代中国史研究》（双月刊）和专业网站——中华人民共和国国史网；主办国家一级学术社团——中华人民共和国国史学会；主管当代中国出版社。
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山西省考古研究所
山西省考古研究所隶属于山西省文物局，是全省唯一具有考古发掘团体领队资格的单位，担负着山西境内地下文物的调查、发掘、研究和保护等工作任务。
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中国检验检疫科学研究院（CAIQ）
中国检验检疫科学研究院（CAIQ）是国家设立的公益性科学研究机构，2004年建院，前身是成立于1954年的农业部植物检疫实验所和成立于1979年的中国进出口商品检验技术研究所。主要任务是开展检验检测检疫应用研究，以及相关基础、高新技术和软科学研究，着重解决检验检测检疫工作中带有全局性、综合性、关键性、突发性、基础性的科学技术问题，为国家检验检测检疫决策、市场综合监管和质量安全提升提供技术支持，为质量安全科普教育及社会实践培训提供科技服务。
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